公司申请专利注册的流程通常包括以下几个步骤：准备申请文件，包括请求书、说明书、权利要求书、说明书附图等。外观设计专利需要附加图片或照片，并进行简要说明。可以直接到专利局大厅或地方专利代办窗口提交材料。或者通过邮寄方式提交，但通常只能使用EM